md5 нужны для репозитория apt, а sha256 является уникальным ID для пакета и depot. Было бы неплохо сразу в процессе сборки подсчитывать hash rpm пакета (как src так и результата) для каждого подзадания и размещать их где-то в структуре build (например в build/<subtask>/<arch>/{srpm,rpms}.checksumms Сейчас такие хеши можно выгрести из разных мест (из репозитория apt и plan), но подсчёт запускается только после завершения стадии сборки и отсутствует для FAILED заданий.
apt теперь ещё и blake2b считает.
Точнее говоря, считает apt-repo-tools, apt использует.
Да, и этот FR стал важнее, т.к. нам приходится считать ещё и blake2b, плюс пересчитывать хеши src.rpm для заданий, у которых репозиторий сгенерён, т.к. в build/repo отсутствует репозиторий для source компоненты.