В пакете есть каталог /var/run/httpd2, который нужен для запуска apache2 и для работы с конфигурацией по-умолчанию. При запуске под systemd необходимо создавать этот каталог каждый раз заново.
apache2-2.2.22-alt3 -> sisyphus: * Tue Aug 07 2012 2012 Aleksey Avdeev <solo@altlinux> 2.2.22-alt3 - Add %_sysconfdir/tmpfiles.d/%name (Closes: #27604)