/etc/firsttime.flag создаётся инсталлятором или при сборке rootfs. Уже сейчас пакет startup на системах с systemd может быть удалён. Повторная установка приведёт к тому, что при следующей загрузке выполнятся скрипты из /etc/firsttime.d/ Поэтому предлагаю не создавать /etc/firsttime.flag при первой установке. См. также: https://lists.altlinux.org/pipermail/devel/2024-September/218848.html